“活化石”澳大利亞肺魚基因組測(cè)序完成 或揭示陸地生命進(jìn)化線索
（神秘的活化石地球uux.cn報(bào)道）據(jù)cnBeta：外媒New Atlas報(bào)道，基因組測(cè)序可以讓科學(xué)家了解一個(gè)物種的利亞陸地大量信息，現(xiàn)在科學(xué)家們已經(jīng)完成了世界上最奇怪、肺魚最有趣的基因揭示進(jìn)化動(dòng)物之一—澳大利亞肺魚的基因組測(cè)序。澳大利亞肺魚被認(rèn)為是組測(cè)“活化石”，它的序完線索基因組顯示，其擁有迄今已測(cè)序所有動(dòng)物最大的成或基因組。
澳大利亞肺魚是生命世界上六種肺魚之一，它是活化石一種奇特的生物。顧名思義，利亞陸地它的肺魚背部有鰾（肺），可以讓它呼吸空氣，基因揭示進(jìn)化而且由于它的組測(cè)胸鰭和骨盆鰭肉質(zhì)發(fā)達(dá)，可以像蠑螈一樣在河床上“行走”。序完線索
在這兩個(gè)特點(diǎn)的成或共同作用下，澳大利亞肺魚喜歡爬出它在河流和淡水池中的家，冒險(xiǎn)來(lái)到干燥的陸地上。它并不是真正的兩棲動(dòng)物，但已知它可以離開水生活幾天--只要它的皮膚不至于太干。
這是進(jìn)化史上最重要的步驟之一。大約在4.2億年前的泥盆紀(jì)時(shí)期 ，當(dāng)?shù)谝慌鷦?dòng)物從海洋中爬到干燥的陸地上時(shí)，澳大利亞肺魚是這些先驅(qū)海洋生物最接近的近親之一，而且由于它在1億多年的進(jìn)化過(guò)程中基本沒有發(fā)生變化，因此它的基因組可能保留了對(duì)那個(gè)關(guān)鍵時(shí)期的了解。
所以歐洲的科學(xué)家們開始對(duì)這個(gè)完整的基因組進(jìn)行測(cè)序。目前科學(xué)家已經(jīng)對(duì)許多動(dòng)物、植物和感興趣的微生物進(jìn)行了測(cè)序，包括人類、老鼠、蠕蟲、蚊子、塔斯馬尼亞虎、鯊魚、蘋果、西紅柿、小麥、大麥和黑死病菌等。
結(jié)果發(fā)現(xiàn)，澳大利亞肺魚的基因組是有史以來(lái)測(cè)序過(guò)的動(dòng)物中最大的，包含約430億個(gè)DNA堿基對(duì)。這超過(guò)人類基因組14倍，比之前的記錄保持者--美西鈍口螈的320億個(gè)DNA堿基對(duì)超出不少。
研究小組發(fā)現(xiàn)，驚人的規(guī)模主要?dú)w結(jié)于重復(fù)。大約90%的肺魚基因組是由重復(fù)序列組成的，這些序列在基因組中的位置會(huì)有變化。在這方面，研究小組表示，與其他魚類相比，肺魚其實(shí)更接近陸地脊椎動(dòng)物。隨著基因組的完全測(cè)序，研究人員能夠確認(rèn)，肺魚是四足動(dòng)物最接近的活體魚類近親，四足動(dòng)物是絕對(duì)巨大的陸生動(dòng)物群體，包含兩棲類、爬行類、鳥類、哺乳類動(dòng)物等。
科學(xué)家發(fā)現(xiàn)，控制肺魚肺部胚胎發(fā)育的基因和人類的基因是一樣的，這說(shuō)明這兩個(gè)物種的進(jìn)化可以追溯到同一個(gè)起源。它們鰭部的骨骼發(fā)育也是由與我們手部相同的基因控制的。研究小組還發(fā)現(xiàn)了一些對(duì)陸地生活的基因組預(yù)適應(yīng)。肺魚的基因組在與空氣呼吸、肢體發(fā)育、繁殖以及嗅覺能力有關(guān)的領(lǐng)域都有所擴(kuò)展。總之，對(duì)澳大利亞肺魚基因組的測(cè)序?qū)⒂兄谔岣呶覀儗?duì)進(jìn)化史上最重要的過(guò)渡之一的理解。
該研究發(fā)表在《自然》雜志上。
相關(guān)報(bào)道：澳大利亞肺魚擁有已測(cè)序最大動(dòng)物基因組
（神秘的地球uux.cn報(bào)道）據(jù)科技日?qǐng)?bào)：英國(guó)《新科學(xué)家》雜志網(wǎng)站18日?qǐng)?bào)道，奧地利分子病理學(xué)研究所的科學(xué)家發(fā)現(xiàn)，澳大利亞肺魚擁有迄今已測(cè)序所有動(dòng)物最大的基因組，其基因組共包含430億對(duì)堿基，超過(guò)人類基因組14倍。最新研究負(fù)責(zé)人齊格弗里德·斯克洛斯寧表示，此前最大已測(cè)序動(dòng)物基因組來(lái)自墨西哥兩棲動(dòng)物美西螈。
在最新研究中，科學(xué)家們使用高性能計(jì)算機(jī)測(cè)序儀將肺魚的基因組拼接起來(lái)。為解決測(cè)序儀可能造成的錯(cuò)誤，研究人員使用了基因組的多個(gè)拷貝，每個(gè)拷貝都被分割成DNA小塊。在對(duì)所有片段進(jìn)行測(cè)序后，研究小組使用算法將片段重組成一個(gè)完整的基因組。斯克洛斯寧估計(jì)，得到結(jié)果需要計(jì)算機(jī)處理大約10萬(wàn)小時(shí)。
斯克洛斯寧說(shuō)，澳大利亞肺魚原產(chǎn)于昆士蘭州東南部，該動(dòng)物從水基生活方式過(guò)渡到陸基生活方式以來(lái)，其外貌幾乎沒有什么變化。
此前，科學(xué)家們并不清楚肺魚和腔棘魚（一種發(fā)現(xiàn)于印度洋和印度尼西亞周圍的古老魚類）誰(shuí)與哺乳動(dòng)物和鳥類等陸地脊椎動(dòng)物的關(guān)系更密切。新基因組分析明確指出，肺魚與四足動(dòng)物的祖先關(guān)系更密切。腔棘魚較早從這些動(dòng)物中分化出來(lái)；而肺魚在4.2億年前才與這些動(dòng)物分道揚(yáng)鑣。
斯克洛斯寧說(shuō)：“為離開水，肺魚需要適應(yīng)陸地的生活方式，必須能呼吸空氣，必須能聞到氣味。肺魚背部擁有一個(gè)肺，供其呼吸水面上的空氣。”
在與肺和關(guān)節(jié)肢體的發(fā)育以及嗅探氣味有關(guān)基因的數(shù)量方面，澳大利亞肺魚與兩棲動(dòng)物相似。斯克洛斯寧說(shuō)：“從基因組角度而言，澳大利亞肺魚的基因組介于魚類和陸地脊椎動(dòng)物之間。”
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